PDB File (Apa Itu dan Cara Membukanya)

Daftar Isi:

PDB File (Apa Itu dan Cara Membukanya)
PDB File (Apa Itu dan Cara Membukanya)
Anonim

Yang Perlu Diketahui

  • Beberapa file PDB adalah file database program.
  • Buka satu dengan editor teks atau program seperti Geneious.
  • Konversi ke format lain dengan program yang sama yang membuka file database spesifik Anda.

Artikel ini menjelaskan apa itu file PDB, cara membukanya, dan cara mengonversinya ke format lain.

Apa Itu File PDB?

File dengan ekstensi file PDB kemungkinan besar adalah file database program yang digunakan untuk menyimpan informasi debug tentang program atau modul, seperti file DLL atau EXE. Mereka kadang-kadang disebut file simbol.

File memetakan berbagai komponen dan pernyataan dalam kode sumber ke produk akhir yang dikompilasi, yang kemudian dapat digunakan oleh debugger untuk menemukan file sumber dan lokasi di executable yang harus menghentikan proses debug.

Beberapa file PDB mungkin dalam format file Protein Data Bank. Ini adalah file teks biasa yang menyimpan koordinat mengenai struktur protein.

File PDB lain mungkin dibuat dalam format file Palm Database atau PalmDOC dan digunakan dengan sistem operasi seluler PalmOS; beberapa file dalam format ini menggunakan ekstensi file. PRC. Format lain yang menggunakan ekstensi yang sama adalah Tanida Demo Builder.

Image
Image

Cara Membuka File PDB

Program yang berbeda menggunakan file PDB mereka sendiri untuk menyimpan data dalam beberapa jenis format database terstruktur, sehingga setiap aplikasi digunakan untuk membuka jenisnya sendiri.

Geneious, Quicken, Visual Studio, dan Pegasus hanyalah beberapa contoh program yang mungkin menggunakan file sebagai file database. Radare dan PDBparse mungkin juga berfungsi.

Beberapa file PDB disimpan sebagai teks biasa, seperti file Database Debug Program Geneious, dan sepenuhnya dapat dibaca manusia jika dibuka di editor teks. Anda dapat membuka file PDB jenis ini dengan program apa pun yang dapat membaca dokumen teks, seperti program Notepad bawaan di Windows. Beberapa viewer dan editor lain yang kompatibel termasuk Notepad++ dan Brackets.

File PDB lainnya bukan dokumen teks dan hanya berguna saat dibuka dengan program yang dimaksudkan. Misalnya, jika milik Anda terkait dengan Quicken, coba gunakan perangkat lunak itu untuk melihat atau mengeditnya. Visual Studio mengharapkan untuk melihat file PDB di folder yang sama dengan file DLL atau EXE.

Anda dapat melihat dan mengedit file Protein Data Bank di Windows, Linux, dan macOS dengan Avogadro. Program-program ini juga dapat membuka file: Jmol, RasMol, QuickPDB, dan USCF Chimera. Karena ini adalah teks biasa, Anda juga dapat membukanya di editor teks.

Palm Desktop seharusnya dapat membuka file ini jika dalam format file Palm Database, tetapi Anda mungkin harus menamainya terlebih dahulu agar memiliki ekstensi file PRC agar program tersebut dapat mengenalinya. Kaliber adalah pilihan lain.

Untuk membuka file PDB PalmDOC, coba STDU Viewer.

Tanida Demo Builder membuka file dalam format tersebut.

Cara Mengonversi File PDB

File database program kemungkinan besar tidak dapat dikonversi ke format file yang berbeda, setidaknya tidak dengan alat pengonversi file biasa. Sebaliknya, jika ada aplikasi yang dapat mengonversi file semacam ini, itu akan menjadi program yang sama yang dapat membukanya.

Misalnya, jika Anda perlu mengonversi file database dari Quicken, coba gunakan program itu untuk melakukannya. Jenis konversi ini, bagaimanapun, mungkin tidak hanya sedikit digunakan tetapi juga tidak didukung dalam aplikasi database ini (yaitu, Anda mungkin tidak perlu mengonversi jenis file PDB ini ke format lain).

File Bank Data Protein dapat dikonversi ke format lain dengan MeshLab. Untuk melakukan ini, Anda mungkin harus terlebih dahulu mengonversinya ke WRL dengan PyMOL dari File > Save Image As > VRMLmenu, lalu impor file WRL ke MeshLab dan gunakan menu File > Ekspor Mesh As untuk mengubah file PDB menjadi STL atau format file lain.

Jika Anda tidak ingin model berwarna, Anda dapat mengekspor file langsung ke STL dengan USCF Chimera (tautan unduhan ada di atas). Jika tidak, Anda dapat menggunakan metode yang sama seperti di atas (dengan MeshLab) untuk mengonversi PDB ke WRL dengan USCF Chimera dan kemudian mengekspor WRL ke STL dengan MeshLab.

Untuk mengonversi PDB ke PDF atau EPUB, jika Anda memiliki file PalmDOC, dimungkinkan dalam beberapa cara, tetapi yang paling mudah mungkin menggunakan konverter online seperti Zamzar. Anda dapat mengunggah file Anda ke situs web tersebut untuk memiliki opsi untuk mengonversinya ke format tersebut serta ke AZW3, FB2, MOBI, PML, RRC, TXT, dan format file eBook lainnya.

Untuk mengonversi satu ke format FASTA dapat dilakukan dengan konverter PDB ke FASTA online Meiler Lab.

Ini juga memungkinkan untuk menyimpan file ini ke CIF (Crystallographic Information format) online menggunakan PDBx/mmCIF.

Masih Tidak Bisa Membukanya?

File yang tidak dapat dibuka dengan alat apa pun dari atas, mungkin sebenarnya bukan file PDB. Apa yang mungkin terjadi adalah Anda salah membaca ekstensi file; beberapa format menggunakan akhiran yang sangat mirip dengan PDB, padahal sebenarnya tidak terkait dan tidak berfungsi sama.

Misalnya, file PDF adalah file dokumen, tetapi sebagian besar program di atas tidak akan merender teks dan/atau gambar dengan benar jika Anda mencoba membukanya dengan program perangkat lunak ini. Hal yang sama berlaku untuk file lain dengan ekstensi file yang dieja serupa, seperti file DBF, DB, ADP, PD, PDE, PDC, PDO, dan WPD.

PBD adalah program lain yang dimiliki oleh program EaseUS Todo Backup dan oleh karena itu hanya berguna saat dibuka dengan perangkat lunak tersebut.

Jika Anda tidak memiliki file PDB, teliti ekstensi file yang dimiliki file Anda sehingga Anda dapat menemukan program yang sesuai untuk membuka atau mengonversinya.

Pembacaan Lanjutan pada File PDB

Anda dapat membaca lebih banyak tentang file database program dari GitHub dan Wintellect.

Ada lebih banyak untuk dipelajari tentang file Protein Data Bank juga; lihat Worldwide Protein Data Bank dan RCSB PDB.

Pertanyaan yang Sering Diajukan

  • Bagaimana cara memperbaikinya ketika Visual Studio tidak dapat menemukan atau membuka file PDB? Jika Anda melihat pesan yang menyatakan bahwa Visual Studio tidak dapat menemukan atau membuka file PDB, coba menggunakan alat debugging Visual Studio. Pergi ke Tools > Options > Debugging > Symbols dan pilih Microsoft Symbol Server
  • Bagaimana cara membuka file PDB di Android? Untuk membuka file PDB di Android, gunakan pembaca file pihak ketiga. Unduh aplikasi Cool Reader atau pembaca file PDB lainnya yang didukung di Google Play.

Direkomendasikan: